菊花茶的副作用有脾胃损伤、过敏性结膜炎、食物中毒，具体情况如下：1.脾胃损伤：菊花性微寒，长期饮用菊花茶会导致脾胃损伤，出现食欲不振、反酸、腹胀、腹痛、腹泻等症状。2.过敏性结膜炎：若患者曾经患有枯草热性结膜炎，在饮用菊花茶后，可能会诱发过敏性结膜炎。3.食物中毒：菊花茶在常温下放置时间过久会出现变质，其中含有大量的致病菌，饮用后可能会出现食物中毒，出现恶心、呕吐、腹痛等症状。孕妇、大病初愈者、幼儿等人不建议饮用，此类人群胃肠功能不佳，饮用后出现副作用的可能性较大。上火、中暑者可适量饮用，可以清热降火，促进身体的康复。
